Wybrandtsminde er opkaldt efter familien Wybrandt, der ejede den gennem flere generationer.
På Wybrandtsminde har der gennem århundreder været dyrket grøntsager og holdt kvæg. Grøntsagerne blev kørt til torvet i København, og ved Amagerlands Producentforenings store udstilling i 1930 i Forum, præsenterede gårdejeren sine varer på en stand, medbringende både hest og hestevogn.
I 1935 indkøbte man på Wybrandtsminde en traktor, om var en af de første på Amager.
Landbrugsproduktionen er fortsat i gang på gården i 2020.
Selvom gården Wybrandtsminde kan føre sin historie tilbage til omkring 1770, så er bomærket af nyere dato. Det indeholder nemlig Peter Crillesen Wybrandts initialer, og han overtog gården i 1858 sammen med sin mor og to brødre.
Peter Wybrandt bestyrede tidligere en gård på Kirkevej, men hvor bomærket derfra er blevet af, vides ikke, men han kreerede i hvert fald sit eget, som han og broderen Jan benyttede på Saltholm.